Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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TrdnE9Q9K5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TrdnE9Q9K5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TrdnE9Q9K5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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TrdnE9Q9K5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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