Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Urb2E9Q7L1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Urb2E9Q7L1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Urb2E9Q7L1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms