Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CenpfE9Q3P4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CenpfE9Q3P4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms