Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Susd1E9Q3H4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Susd1E9Q3H4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms