Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tarbp1E9Q368 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tarbp1E9Q368 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tarbp1E9Q368 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms