Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc4E9Q236 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc4E9Q236 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms