Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc171E9Q1U1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc171E9Q1U1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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