Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc1E9Q043 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Fndc1E9Q043 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms