Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ddx60E9PZQ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ddx60E9PZQ1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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