Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scaf11E9PZM7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scaf11E9PZM7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scaf11E9PZM7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms