Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rsph10bE9PYQ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rsph10bE9PYQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms