Protein–RNA interactions for Protein: E9PYF4

Lmo7, LIM domain only 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo7E9PYF4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lmo7E9PYF4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lmo7E9PYF4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lmo7E9PYF4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms