Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4931408C20RikE9PWP9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4931408C20RikE9PWP9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms