Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms