Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD3

Dchs1, Protocadherin-16, mousemouse

Predictions only

Length 3,291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dchs1E9PVD3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dchs1E9PVD3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dchs1E9PVD3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dchs1E9PVD3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dchs1E9PVD3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Dchs1E9PVD3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms