Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syde2E9PUP1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Syde2E9PUP1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms