Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atp6ap1lD3Z5W0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms