Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc170D3YXL0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc170D3YXL0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms