Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
BC048679D3YXE9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BC048679D3YXE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms