Protein–RNA interactions for Protein: C0HKD9

Mfap1b, Microfibrillar-associated protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfap1bC0HKD9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfap1bC0HKD9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfap1bC0HKD9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mfap1bC0HKD9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mfap1bC0HKD9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mfap1bC0HKD9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms