Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppfia4B8QI36 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppfia4B8QI36 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms