Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Cyp26c1B2RXA7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cyp26c1B2RXA7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms