Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700018F24RikB2RW27 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700018F24RikB2RW27 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms