Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clrn2B2RVW2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Clrn2B2RVW2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Clrn2B2RVW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms