Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Slc22a28B2RT89 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc22a28B2RT89 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms