Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ythdc2B2RR83 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ythdc2B2RR83 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ythdc2B2RR83 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms