Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Scml2B1AVB3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Scml2B1AVB3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms