Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trabd2bB1ATG9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trabd2bB1ATG9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trabd2bB1ATG9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms