Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Spocd1B1ASB6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Spocd1B1ASB6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms