Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Grik3B1AS29 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Grik3B1AS29 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Grik3B1AS29 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms