Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prr29B1ARI9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Prr29B1ARI9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms