Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp4A4UUI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp4A4UUI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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