Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Samt1A2BED8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Samt1A2BED8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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