Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col6a4A2AX52 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Col6a4A2AX52 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms