Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Upf2A2AT37 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Upf2A2AT37 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms