Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pramef17A2ASJ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pramef17A2ASJ1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms