Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI9

Pramef25, PRAME family member 25, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef25A2ASI9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pramef25A2ASI9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramef25A2ASI9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms