Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SetxA2AKX3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SetxA2AKX3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms