Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FocadA2AKG8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FocadA2AKG8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FocadA2AKG8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms