Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VirmaA2AIV2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VirmaA2AIV2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VirmaA2AIV2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms