Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ambra1A2AH22 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ambra1A2AH22 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ambra1A2AH22 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms