Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ckap5A2AGT5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ckap5A2AGT5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms