Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhbdl2A2AGA4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rhbdl2A2AGA4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms