Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cfap99A0A140LIX9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cfap99A0A140LIX9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms