Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4921501E09RikA0A0R4J054 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4921501E09RikA0A0R4J054 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms