Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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