Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms