Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Trbv26A0A0B4J1P5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trbv26A0A0B4J1P5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv26A0A0B4J1P5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Trbv26A0A0B4J1P5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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