Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Trbv15A0A0A6YYE3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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