Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1B8

Phf1, PHD finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf1Q9Z1B8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Phf1Q9Z1B8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phf1Q9Z1B8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phf1Q9Z1B8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Phf1Q9Z1B8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Phf1Q9Z1B8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Phf1Q9Z1B8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Phf1Q9Z1B8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms